또한 1990년 2월 12일 체육진흥국 내에서 사회체육과가 생활체육과로 개칭되고, 학교체육과가
폐지되고 사업관리과가 신설되었으며, 체육과학국이 체육지도국으로 개칭되었으나, 여전히
체육관련 조직은 체육진흥국(생활체육과, 사업관리과, 체육시설과), 체육지도국(조사기획과,
훈련과, 지도육성과), 국제체육국(지원총괄과, 국제경기과, 해외협력담당관) 체제를 유지하였다.
한편 학교체육업무 중 급식관련 업무는 1989년에 발표된 행정개혁위원회의 「행정개혁에 관한
건의」에 따라 교육부로 이관되었다.